За намаляване и антропогенният натиск върху морската среда са планирани мерки, с които да се гарантира постигането на целите на Морската стратегия за опазване на морските води. Те са свързани със защитата и съхраняването на морската околна среда, с предотвратяване на нейното влошаване и възстановяване на морските екосистеми в територии, които са били неблагоприятно засегнати.
Мерките са свързани и с предотвратяване и намаляване на въвеждането и освобождаването на вещества с антропогенен произход в околната среда. Целта е поетапното премахване на замърсяването и гарантиране на липсата на съществено въздействие или опасност за човешкото здраве, биологичното разнообразие на морските екосистеми и законосъобразното използване на морето.
С Морската стратегия и програмата от мерки се изпълняват изискванията на Рамкова директива за морска стратегия, чиято основна цел е поддържане или постигане на добро екологично състояние на морската околна среда до 2020 г. Въвежда се и принципът на дългосрочно планиране и координирано прилагане на Рамковата директива между компетентните органи, имащи отношение към опазването на морската околна среда.